Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms