Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Msx3P70354 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx3P70354 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms