Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tbx6P70327 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms