Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms