Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DccP70211 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DccP70211 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DccP70211 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DccP70211 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DccP70211 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DccP70211 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DccP70211 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DccP70211 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DccP70211 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DccP70211 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DccP70211 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DccP70211 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DccP70211 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DccP70211 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms