Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrig1P70193 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms