Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acta1P68134 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acta1P68134 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms