Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps3P62908 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps3P62908 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps3P62908 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms