Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpd1P62315 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms