Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5r1P61809 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms