Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnnP61807 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnnP61807 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnnP61807 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnnP61807 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnnP61807 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnnP61807 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnnP61807 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SnnP61807 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SnnP61807 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SnnP61807 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SnnP61807 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms