Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vbp1P61759 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vbp1P61759 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms