Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga11P61622 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms