Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arf3P61205 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms