Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fgf1P61148 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms