Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sem1P60897 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms