Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ppfia3P60469 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms