Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms