Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp4P59240 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms