Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms