Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp1P59110 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Senp1P59110 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Senp1P59110 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms