Protein–RNA interactions for Protein: P58390

Kcnn2, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn2P58390 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn2P58390 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kcnn2P58390 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms