Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf16P58334 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms