Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dpf3P58269 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms