Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpdl3bP58242 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms