Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn18P56857 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn18P56857 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn18P56857 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn18P56857 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn18P56857 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn18P56857 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms