Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcd5P56812 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdcd5P56812 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms