Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irf5P56477 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irf5P56477 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf5P56477 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms