Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gp1bbP56400 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms