Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp5P56399 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Usp5P56399 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms