Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CdaP56389 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CdaP56389 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CdaP56389 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CdaP56389 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CdaP56389 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CdaP56389 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CdaP56389 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CdaP56389 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CdaP56389 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CdaP56389 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CdaP56389 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CdaP56389 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CdaP56389 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CdaP56389 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CdaP56389 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CdaP56389 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CdaP56389 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CdaP56389 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CdaP56389 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms