Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab4aP56371 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab4aP56371 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab4aP56371 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab4aP56371 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab4aP56371 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab4aP56371 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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