Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ephb3P54754 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms