Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad23aP54726 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms