Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fdft1P53798 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms