Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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