Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp1P52624 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp1P52624 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms