Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms