Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcnfP51944 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnfP51944 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms