Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApodP51910 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApodP51910 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ApodP51910 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ApodP51910 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApodP51910 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApodP51910 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApodP51910 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms