Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LumP51885 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LumP51885 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LumP51885 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LumP51885 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LumP51885 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LumP51885 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms