Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr3P51678 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms