Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MipP51180 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MipP51180 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MipP51180 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MipP51180 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MipP51180 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MipP51180 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms