Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FmodP50608 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FmodP50608 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FmodP50608 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FmodP50608 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FmodP50608 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FmodP50608 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FmodP50608 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FmodP50608 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FmodP50608 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FmodP50608 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FmodP50608 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms