Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cxcl5P50228 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cxcl5P50228 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cxcl5P50228 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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