Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cav1P49817 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms