Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcls1P49710 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms