Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CitP49025 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CitP49025 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CitP49025 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CitP49025 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CitP49025 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CitP49025 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CitP49025 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms