Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms