Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VdrP48281 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VdrP48281 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VdrP48281 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VdrP48281 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VdrP48281 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VdrP48281 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VdrP48281 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VdrP48281 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VdrP48281 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VdrP48281 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VdrP48281 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VdrP48281 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms